MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae KR494

Total Repeats: 33773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022356	AATT	2	8	55	62	50 %	50 %	0 %	0 %	543951067
2	NC_022356	A	7	7	65	71	100 %	0 %	0 %	0 %	543951067
3	NC_022356	TTGGCA	2	12	124	135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543951067
4	NC_022356	TGG	2	6	180	185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951067
5	NC_022356	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	543951067
6	NC_022356	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	543951067
7	NC_022356	ATG	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951067
8	NC_022356	CTG	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951067
9	NC_022356	ATAA	2	8	441	448	75 %	25 %	0 %	0 %	543951067
10	NC_022356	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	543951067
11	NC_022356	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951068
12	NC_022356	T	6	6	512	517	0 %	100 %	0 %	0 %	543951068
13	NC_022356	TGC	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
14	NC_022356	ATC	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
15	NC_022356	ATA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
16	NC_022356	TTTTCA	2	12	693	704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543951068
17	NC_022356	GCT	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
18	NC_022356	CAT	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
19	NC_022356	TCT	2	6	837	842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
20	NC_022356	TTCATT	2	12	878	889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543951068
21	NC_022356	AACC	2	8	891	898	50 %	0 %	0 %	50 %	543951068
22	NC_022356	GTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951068
23	NC_022356	AAT	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
24	NC_022356	GAA	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951068
25	NC_022356	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
26	NC_022356	ACGAA	2	10	1155	1164	60 %	0 %	20 %	20 %	543951068
27	NC_022356	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	543951068
28	NC_022356	ATA	2	6	1208	1213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
29	NC_022356	TTC	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
30	NC_022356	TGC	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
31	NC_022356	CAT	2	6	1310	1315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
32	NC_022356	ATTA	2	8	1467	1474	50 %	50 %	0 %	0 %	543951069
33	NC_022356	TCA	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951069
34	NC_022356	TAG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951069
35	NC_022356	TCT	2	6	1566	1571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951069
36	NC_022356	TTG	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951069
37	NC_022356	GCGAA	2	10	1658	1667	40 %	0 %	40 %	20 %	543951069
38	NC_022356	ATA	2	6	1701	1706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951069
39	NC_022356	TCA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951069
40	NC_022356	GAT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951069
41	NC_022356	ATA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951070
42	NC_022356	TTAA	2	8	1956	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	543951070
43	NC_022356	ATCA	2	8	2027	2034	50 %	25 %	0 %	25 %	543951070
44	NC_022356	T	6	6	2099	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	543951070
45	NC_022356	T	6	6	2107	2112	0 %	100 %	0 %	0 %	543951070
46	NC_022356	TCA	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951070
47	NC_022356	T	7	7	2291	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	543951070
48	NC_022356	TCGT	2	8	2403	2410	0 %	50 %	25 %	25 %	543951070
49	NC_022356	ATT	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951070
50	NC_022356	CCA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951070
51	NC_022356	ATC	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951070
52	NC_022356	A	7	7	2700	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	543951070
53	NC_022356	TTG	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951070
54	NC_022356	AAT	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951070
55	NC_022356	TG	3	6	2877	2882	0 %	50 %	50 %	0 %	543951071
56	NC_022356	CT	3	6	2891	2896	0 %	50 %	0 %	50 %	543951071
57	NC_022356	GAC	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951071
58	NC_022356	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
59	NC_022356	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
60	NC_022356	CAT	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951071
61	NC_022356	TGG	3	9	3088	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951071
62	NC_022356	CATT	2	8	3169	3176	25 %	50 %	0 %	25 %	543951071
63	NC_022356	TTG	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951071
64	NC_022356	AATC	2	8	3202	3209	50 %	25 %	0 %	25 %	543951071
65	NC_022356	CTT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
66	NC_022356	ACC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951071
67	NC_022356	AAT	2	6	3320	3325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
68	NC_022356	CTTTT	2	10	3335	3344	0 %	80 %	0 %	20 %	543951071
69	NC_022356	TCT	2	6	3354	3359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
70	NC_022356	TTC	2	6	3360	3365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
71	NC_022356	AAGT	2	8	3382	3389	50 %	25 %	25 %	0 %	543951071
72	NC_022356	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
73	NC_022356	TTC	2	6	3455	3460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
74	NC_022356	TAA	2	6	3464	3469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
75	NC_022356	TTCT	2	8	3476	3483	0 %	75 %	0 %	25 %	543951071
76	NC_022356	AGCA	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	543951071
77	NC_022356	TTC	2	6	3593	3598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
78	NC_022356	ATT	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951071
79	NC_022356	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
80	NC_022356	T	6	6	3835	3840	0 %	100 %	0 %	0 %	543951071
81	NC_022356	CTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
82	NC_022356	ATTGA	2	10	3956	3965	40 %	40 %	20 %	0 %	543951071
83	NC_022356	AAC	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951071
84	NC_022356	AAT	2	6	4141	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
85	NC_022356	TAGT	2	8	4161	4168	25 %	50 %	25 %	0 %	543951071
86	NC_022356	GCT	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951071
87	NC_022356	T	6	6	4185	4190	0 %	100 %	0 %	0 %	543951071
88	NC_022356	GC	3	6	4202	4207	0 %	0 %	50 %	50 %	543951071
89	NC_022356	ATGA	2	8	4306	4313	50 %	25 %	25 %	0 %	543951071
90	NC_022356	ACG	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951071
91	NC_022356	GTT	2	6	4357	4362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951071
92	NC_022356	CAT	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951071
93	NC_022356	TTA	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951071
94	NC_022356	ATAA	2	8	4497	4504	75 %	25 %	0 %	0 %	543951071
95	NC_022356	TCT	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951072
96	NC_022356	TGA	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951072
97	NC_022356	AC	3	6	4678	4683	50 %	0 %	0 %	50 %	543951072
98	NC_022356	ACC	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951072
99	NC_022356	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951072
100	NC_022356	GAAA	2	8	4887	4894	75 %	0 %	25 %	0 %	543951072
101	NC_022356	ATA	2	6	4963	4968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951072
102	NC_022356	ATC	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951072
103	NC_022356	TCG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951072
104	NC_022356	TG	3	6	5070	5075	0 %	50 %	50 %	0 %	543951072
105	NC_022356	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951073
106	NC_022356	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951073
107	NC_022356	TTG	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951073
108	NC_022356	GTTG	2	8	5599	5606	0 %	50 %	50 %	0 %	543951073
109	NC_022356	AAT	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951073
110	NC_022356	TAT	2	6	5760	5765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
111	NC_022356	TTG	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
112	NC_022356	TTC	2	6	5788	5793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
113	NC_022356	T	6	6	5874	5879	0 %	100 %	0 %	0 %	543951074
114	NC_022356	CAG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951074
115	NC_022356	TGG	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951074
116	NC_022356	TTTG	2	8	5999	6006	0 %	75 %	25 %	0 %	543951074
117	NC_022356	ATTTGA	2	12	6046	6057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543951074
118	NC_022356	GTT	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
119	NC_022356	CAT	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
120	NC_022356	CTTC	2	8	6237	6244	0 %	50 %	0 %	50 %	543951074
121	NC_022356	TTC	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
122	NC_022356	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951074
123	NC_022356	T	6	6	6369	6374	0 %	100 %	0 %	0 %	543951074
124	NC_022356	AT	3	6	6426	6431	50 %	50 %	0 %	0 %	543951074
125	NC_022356	CATT	2	8	6486	6493	25 %	50 %	0 %	25 %	543951074
126	NC_022356	TAT	2	6	6561	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
127	NC_022356	T	6	6	6576	6581	0 %	100 %	0 %	0 %	543951074
128	NC_022356	GCT	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951074
129	NC_022356	ATCTAA	2	12	6718	6729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543951074
130	NC_022356	AC	3	6	6801	6806	50 %	0 %	0 %	50 %	543951074
131	NC_022356	ATT	2	6	6823	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
132	NC_022356	C	7	7	6837	6843	0 %	0 %	0 %	100 %	543951074
133	NC_022356	CTT	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
134	NC_022356	CAT	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
135	NC_022356	TAC	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
136	NC_022356	ATCT	2	8	6999	7006	25 %	50 %	0 %	25 %	543951074
137	NC_022356	TCT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
138	NC_022356	ATTT	2	8	7057	7064	25 %	75 %	0 %	0 %	543951074
139	NC_022356	TGAA	2	8	7141	7148	50 %	25 %	25 %	0 %	543951074
140	NC_022356	ATT	2	6	7156	7161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
141	NC_022356	GTTA	2	8	7180	7187	25 %	50 %	25 %	0 %	543951074
142	NC_022356	TCCTT	2	10	7250	7259	0 %	60 %	0 %	40 %	543951074
143	NC_022356	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
144	NC_022356	CGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543951074
145	NC_022356	CCGTAC	2	12	7323	7334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543951074
146	NC_022356	TAT	2	6	7338	7343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
147	NC_022356	T	6	6	7405	7410	0 %	100 %	0 %	0 %	543951074
148	NC_022356	ATT	3	9	7429	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
149	NC_022356	CAG	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951074
150	NC_022356	T	6	6	7642	7647	0 %	100 %	0 %	0 %	543951074
151	NC_022356	AC	3	6	7671	7676	50 %	0 %	0 %	50 %	543951074
152	NC_022356	ATT	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
153	NC_022356	CTT	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
154	NC_022356	CTGTA	2	10	7774	7783	20 %	40 %	20 %	20 %	543951074
155	NC_022356	TCT	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
156	NC_022356	TAA	2	6	7890	7895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951074
157	NC_022356	CTT	2	6	7959	7964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
158	NC_022356	TATTGC	2	12	8007	8018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543951074
159	NC_022356	GTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
160	NC_022356	TAA	3	9	8091	8099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951074
161	NC_022356	TAAA	2	8	8116	8123	75 %	25 %	0 %	0 %	543951074
162	NC_022356	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
163	NC_022356	CTT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
164	NC_022356	GTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951074
165	NC_022356	TGT	2	6	8345	8350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
166	NC_022356	TGT	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
167	NC_022356	ATTTA	2	10	8431	8440	40 %	60 %	0 %	0 %	543951074
168	NC_022356	CCT	2	6	8452	8457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543951075
169	NC_022356	AACT	2	8	8678	8685	50 %	25 %	0 %	25 %	543951075
170	NC_022356	AAT	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
171	NC_022356	ACC	2	6	8793	8798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951075
172	NC_022356	TA	3	6	8909	8914	50 %	50 %	0 %	0 %	543951075
173	NC_022356	TGT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
174	NC_022356	TAA	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
175	NC_022356	TTG	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
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177	NC_022356	TTG	2	6	9173	9178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
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180	NC_022356	AAT	2	6	9311	9316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
181	NC_022356	T	6	6	9328	9333	0 %	100 %	0 %	0 %	543951075
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199	NC_022356	TA	3	6	10399	10404	50 %	50 %	0 %	0 %	543951076
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242	NC_022356	T	6	6	12775	12780	0 %	100 %	0 %	0 %	543951077
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246	NC_022356	TGT	2	6	12939	12944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951077
247	NC_022356	GTTT	2	8	13020	13027	0 %	75 %	25 %	0 %	543951077
248	NC_022356	TTGG	2	8	13039	13046	0 %	50 %	50 %	0 %	543951077
249	NC_022356	T	6	6	13070	13075	0 %	100 %	0 %	0 %	543951077
250	NC_022356	TGGC	2	8	13097	13104	0 %	25 %	50 %	25 %	543951077
251	NC_022356	GA	3	6	13226	13231	50 %	0 %	50 %	0 %	543951077
252	NC_022356	ATC	2	6	13260	13265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951077
253	NC_022356	AT	3	6	13312	13317	50 %	50 %	0 %	0 %	543951077
254	NC_022356	ACG	2	6	13371	13376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951077
255	NC_022356	AAAG	2	8	13450	13457	75 %	0 %	25 %	0 %	543951077
256	NC_022356	T	6	6	13510	13515	0 %	100 %	0 %	0 %	543951077
257	NC_022356	GTT	2	6	13517	13522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951077
258	NC_022356	T	6	6	13554	13559	0 %	100 %	0 %	0 %	543951077
259	NC_022356	ATA	2	6	13647	13652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951077
260	NC_022356	ACC	2	6	13669	13674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951077
261	NC_022356	CAA	2	6	13843	13848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951078
262	NC_022356	CAC	2	6	13965	13970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951078
263	NC_022356	TTGGT	2	10	13992	14001	0 %	60 %	40 %	0 %	543951078
264	NC_022356	TGCGT	2	10	14010	14019	0 %	40 %	40 %	20 %	543951078
265	NC_022356	ATT	2	6	14021	14026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951078
266	NC_022356	ATCGTT	2	12	14060	14071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543951078
267	NC_022356	TTG	2	6	14113	14118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951078
268	NC_022356	TGC	2	6	14160	14165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951078
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387	NC_022356	TGA	2	6	20169	20174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951086
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393	NC_022356	CCT	2	6	20450	20455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543951086
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395	NC_022356	GCA	2	6	20613	20618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951087
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